Des experts ont révélé que « la guerre mondiale contre le terrorisme, menée par l’ancien président américain George W. Bush après les attentats du 11 septembre 2001, a eu de graves conséquences pour les musulmans africains », s’adressant à l’agence Anadolu, Naim Jinnah, directeur exécutif du Centre pour l’Afrique et le Moyen-Orient, basé à Johannesburg (la plus grande ville d’Afrique du Sud), a déclaré que « les droits des musulmans africains ont été violés après que les États-Unis ont lancé la guerre mondiale sur le terrorisme à la suite des attentats du 11 septembre contre le Centre. » Global Trade à New York.
Il a ajouté que « les musulmans africains étaient soumis au même type d’islamophobie que dans les pays occidentaux, ce qui a conduit à des violations des droits de l’homme », « Les États-Unis ont utilisé la guerre contre le terrorisme pour exercer une pression énorme sur les gouvernements africains afin qu’ils se conforment à leurs protocoles de sécurité, partagent des renseignements et renforcent ou développent leurs relations militaires », a noté Jina, il a cité l’exemple du commandement américain pour l’Afrique « AFRICOM », qui, selon lui, a été formé à la suite de la « guerre mondiale contre le terrorisme ».
Il a déclaré que ce leadership « fonctionne désormais dans la plupart des pays du continent, avec peu de respect pour la souveraineté des pays africains », des groupes de défense des droits sur le continent ont accusé les forces de sécurité d’avoir arrêté par erreur des personnes sur de fausses accusations de terrorisme et de les avoir tuées ou détenues dans des lieux inconnus.
Dans un rapport de 2016, le groupe de défense des droits Haki Africa a déclaré que « la police antiterroriste kenyane a commis au moins 81 exécutions extrajudiciaires dans la région côtière à majorité musulmane du pays depuis 2012 », les groupes de défense des droits ont affirmé que le nombre peut être plus élevé, car certaines familles n’ont pas signalé l’abus par crainte d’abus, à cet égard, l’Autorité indépendante de surveillance de la police du Kenya a déclaré qu' »à ce moment-là, 52 policiers avaient été inculpés et des centaines d’autres faisaient l’objet d’une enquête pour violations des droits de l’homme ».